Музеят е основан през 1982 година под пълномощието на Музея на националната история и археологие в Констанца. В съвременната сграда на музея са представени обекти от гръцкото, римското и византийско присъствие, които са открити при разкопките в Истрия и околността: амфори, надписи, керамика, стъклария, орнаменти, еленистични барелефи и други.