Музеят Мугла е разположен в стар затвор зад сградата на съда. В музея са изложени вкаменелости, които са принадлежали на живи същества от преди 5-9 млн. години. Тези същества са били разпространени в един широк регион от Източна Азия до Испания. Друга идтиресна секция в музея е етнографската - в нея са изложени дрехи и други ежедневни предмети от различни части на Мугла.